La nueva estructura está encabezada por el Pleno de la Junta Central Electoral que preside Román Andrés Jáquez Liranzo, seguida de la Dirección de Informática, que dirige el ingeniero Johnny Rivera. Tiene por debajo seis subdirecciones que son: Gestión de Proyectos, Gestión de Calidad, Ingeniería de Software de Registro Civil, Administrativo y Financiero; Ingeniería de Software de Identidad y Electoral, Infraestructura Tecnológica y Seguridad de la Información.

De la subdirección de Gestión de Proyectos estará compuesta por las siguientes áreas: Gestión de cambios de sistemas y plataformas; Análisis de procesos y servicios; Formulación y Evaluación; y Administración de proyectos. La subdirección de Gestión de Calidad está integrada por Mesa de Servicio; Aseguramiento de la Calidad y Pruebas de Software, así como Documentación de Software y Entrenamiento. De igual manera, la Subdirección de Ingeniería de Software de Registro Civil, Administrativo y Financiero está compuesta por el Equipo de Desarrollo (Registro Civil), Equipo de Desarrollo (Administrativo y Financiero) y Equipo de Desarrollo de E-Servicios.

La Subdirección de Ingeniería de Software de Identidad y Electoral está integrada por el Equipo de Desarrollo de Cedulación y Registro Electoral, y el Equipo de Desarrollo de Elecciones. De igual manera, la Subdirección de Infraestructura Tecnológica, está conformada en el nuevo organigrama de la manera siguiente: Infraestructura, Redes y Comunicaciones, Soporte Técnico, Seguridad Informática Operativa y el Centro de Operaciones de Red. Finalmente, la Subdirección de Seguridad de la Información está integrada por las áreas de Gestión de Políticas y Procedimientos de Seguridad de la Información; Gestión de incidentes de seguridad de la información; Continuidad de Negocios; Ciberseguridad y el Centro de Operaciones de Seguridad.

En la disposición, el Pleno de la JCE hizo constar que en la conformación de la nueva estructura fueron valorados  los planteamientos de las organizaciones políticas Partido Reformista Social Cristiano (PRSC), Partido de la Liberación Dominicana (PLD); Partido Fuerza del Pueblo (FP); Bloque Institucional Social Demócrata (BIS); Movimiento Independiente del Municipio de Consuelo (MIMCO); Partido Revolucionario Dominicano (PRD); Partido Quisqueyano Demócrata Cristiano (PQDC)  y Partido Revolucionario Moderno (PRM).