El  agua de la laguna es salobre, pues a pesar de que su fuente es dulce, al conectarse con el agua proveniente del Océano Atlántico, con la subida de la marea, esta pasa a ser salobre. En cuanto a la parte marina del área protegida, es rico en playa, costas rocosas, estuarios y manglares, así como, lagunas y praderas marinas, además de numerosos cayos.